Το πρώτο volume της σειράς The Ghost in the Shell The Human Algorithm γεφυρώνει τα γεγονότα ανάμεσα στα Ghost in the Shell Human Error Processor και Man Machine Interface. Σε ένα τεταμένο cyberpunk θρίλερ, χάκερ επιχειρούν να δολοφονήσουν μια πολιτικό κατά τη διάρκεια ομιλίας υπέρ των κυβερνητικών προσθετικών, ενώ η έρευνα οδηγεί τον Batou σε ένα ύποπτο εργοστάσιο στα τεχνητά νησιά της νότιας Ιαπωνίας. Παράλληλα ο αρχηγός Aramaki ενημερώνεται για παράνομη απόρριψη δεκάδων τεχνητών σωμάτων κοντά σε χωριό αντι κυβερνοποίησης, ανάμεσά τους και ένα κέλυφος που θυμίζει τη Motoko Kusanagi.