Ο Σασούκε και η Σακούρα αντιμετωπίζουν αρχαία μυστικά, θανατηφόρες συνωμοσίες και ακόμη και δράκους σε αυτή τη manga διασκευή του μυθιστορήματος. Χρόνια μετά τον Μεγάλο Πόλεμο των Σινόμπι, ο Ναρούτο προσβάλλεται από μια μυστηριώδη ασθένεια και, αναζητώντας απεγνωσμένα θεραπεία, ο Σασούκε και η Σακούρα ξεκινούν μια επικίνδυνη μυστική αποστολή στη μακρινή χώρα Ρεντάκου. Καθώς κατεβαίνουν βαθύτερα στους κρυφούς θαλάμους κάτω από το παρατηρητήριο και ο δεσμοφύλακας τους παρακολουθεί στενά, πρέπει να εξασφαλίσουν τη θεραπεία του Ναρούτο και να επιβιώσουν από τη μάχη που έρχεται σε ένα συναρπαστικό φινάλε.