Η δεύτερη omnibus έκδοση του D.Gray-man συγκεντρώνει τους τόμους 4, 5 και 6 σε έναν τόμο 576 σελίδων. Ο Άλεν Γουόκερ περιπλανιέται σε μια φανταστική Γη του 19ου αιώνα αναζητώντας την Innocence, μια μυστηριώδη ουσία που χρησιμοποιείται για την καταπολέμηση των δαιμόνων akuma. Καθώς αναρωτιέται αν είναι διατεθειμένος να πολεμήσει τη Φυλή του Νώε, ο τραυματισμός στο αριστερό του μάτι τον εμποδίζει να ξεχωρίζει τους akuma από τους ανθρώπους και τον καθιστά στόχο. Παρά την αδυναμία του, η Μαύρη Υπηρεσία τον στέλνει να βρει και να προστατεύσει τον δάσκαλό του, τον Στρατηγό Cross. Manga σε μορφή trade paperback, με ιστορία και σχέδιο της Katsura Hoshino.