Το Bloody Mary Vol. 3 συνεχίζει τη σκοτεινή ιστορία συμμαχίας ανάμεσα σε έναν βαμπίρ και έναν εξορκιστή. Ο Bloody Mary, ένας βαμπίρ που επιθυμεί να πεθάνει, κυνηγά εδώ και 400 χρόνια τη Maria, μια σύγχρονη εξορκίστρια που θεωρείται ότι έχει κληρονομήσει το αίμα της Maria και είναι η μόνη που μπορεί να τον σκοτώσει. Η Maria όμως δεν ξέρει πώς να σκοτώνει βαμπίρ, οπότε ο Mary συμφωνεί να γίνει σωματοφύλακάς της μέχρι να βρει τρόπο να τον εξοντώσει. Όταν η Maria θυμάται πως ο πατέρας της Yusei σκοτώθηκε από βαμπίρ και το πρόσωπο του δολοφόνου μοιάζει με του Mary, ξεκινά να ψάχνει απαντήσεις και καταλήγει να τον σώσει από απαγωγή, ενώ τα βασανιστήρια του Yzak ξυπνούν κάτι άλλο μέσα του.