Ο Togusa και η νεοσύλλεκτη πράκτορας Tsunagi της Ενότητας 9 στέλνονται βόρεια μετά από αναφορές ότι το τεχνητό σώμα της Ταγματάρχη Kusanagi εμφανίστηκε στην πόλη Towada. Παρόμοιες φήμες οδηγούν τους Batou και Ishikawa εκατοντάδες μίλια νότια για να διεισδύσουν σε μια εγκληματική οργάνωση στην Okinawa. Καθώς οι δύο έρευνες προχωρούν, η Ενότητα 9 ανακαλύπτει ότι ο Hashikami και ο δολοφόνος γνωστός ως White Bear σχεδιάζουν να δολοφονήσουν τον Shinra Mikomoto, τον πρόσφατα εκλεγμένο δήμαρχο της New Port City. Η είδηση φέρνει τα διασκορπισμένα μέλη της Ενότητας 9 πίσω στην πόλη, όπου όλα κρίνονται από τη μοίρα του δημάρχου.