Η τελική δοκιμασία της Αμυντικής Δύναμης ολοκληρώθηκε, όμως οι προκλήσεις για τους εξεταζόμενους δεν τελειώνουν εκεί. Ένα μυστηριώδες ανθρωποειδές kaiju επαναφέρει στη ζωή ένα εξουδετερωμένο honju και το εξαπολύει εναντίον της Kikoru Shinomiya. Τη στιγμή που η Kikoru φαίνεται να μην έχει άλλη διέξοδο, ο Kafka τρέχει να τη σώσει. Ποιος είναι όμως ο στόχος του ανθρωποειδούς kaiju;