Στον κόσμο του Tokyo Ghoul, μερικές φορές ο μόνος τρόπος να πολεμήσεις τα τέρατα είναι να γίνεις ένα από αυτά. Η Επιτροπή Αντιμετώπισης Ghouls δημιουργεί την πειραματική Ομάδα Qs, ερευνητές στους οποίους εμφυτεύεται kagune ενός ghoul ώστε να αποκτήσουν τις δυνάμεις του, με αβέβαιο όμως αποτέλεσμα. Ο Haise Sasaki προσπαθεί να μετατρέψει τα απείθαρχα μέλη της Ομάδας Qs σε επίλεκτη μονάδα, καθώς η έρευνά τους για την οργάνωση Aogiri Tree και το ξεχασμένο παρελθόν του απειλούν να τον στοιχειώσουν.