Πρώτα οι Phantom Thieves αναμόρφωσαν τον διεστραμμένο καθηγητή Σουγκούρου Καμοσίδα. Έπειτα κατάφεραν να αλλάξουν την καρδιά του δεύτερου στόχου τους, του δασκάλου της τέχνης Ιτσιριουσάι Μανταράμε. Όμως στον πραγματικό κόσμο η πρόεδρος του μαθητικού συμβουλίου της Ακαδημίας Shujin, η Μακότο Νιτζίμα, αρχίζει να υποψιάζεται ότι ο Ακίρα και οι φίλοι του δεν είναι απλώς συνηθισμένοι μαθητές. Την ίδια στιγμή, μια εγκληματική οργάνωση στη Σιμπούγια στοχοποιεί μαθητές λυκείου με μια νέα, ύπουλη απάτη. Θα καταφέρουν οι Phantom Thieves να αποδείξουν ότι είναι οι καλοί, κρατώντας κρυφές τις ταυτότητές τους;