Το Shinobi Undercover, Vol. 4 των Ippon Takegushi και Santa Mitarashi συνεχίζει τη ανάλαφρη αλλά γεμάτη δράση ιστορία του Yodaka, ενός επίλεκτου πράκτορα της Δημόσιας Ασφάλειας που ζει διπλή ζωή στο λύκειο και δυσκολεύεται στις κοινωνικές επαφές. Η σχέση του με την Aoi Mukai, την οποία έχει αναλάβει να προστατεύει, γίνεται πιο φυσική, όμως η αμηχανία του κορυφώνεται όταν πρέπει να της αγοράσει δώρο γενεθλίων. Αργότερα, μια επίσκεψη στο σπίτι της Aoi με την επίβλεψη του μυστηριώδους κηδεμόνα της Mimizuku τον οδηγεί στο απομονωμένο συγκρότημα Amamori, όπου μαθαίνει για το τραγικό παρελθόν της και συνειδητοποιεί ότι πρέπει να γίνει δυνατότερος για να την προστατεύσει πραγματικά.